Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK5RAP3Q96JB5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms