Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MVB12AQ96EY5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms