Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DNAJA3Q96EY1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DNAJA3Q96EY1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms