Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms