Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMARCE1Q969G3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms