Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RGP1Q92546 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RGP1Q92546 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms