Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GIPC3Q8TF64 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms