Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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FAT3Q8TDW7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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FAT3Q8TDW7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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FAT3Q8TDW7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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FAT3Q8TDW7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
FAT3Q8TDW7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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