Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC33Q8N5R6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms