Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms