Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPTE2Q6XPS3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPTE2Q6XPS3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms