Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMBOX1Q6NT76 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms