Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CARMIL2Q6F5E8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms