Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms