Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FAM208BQ5VWN6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM208BQ5VWN6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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