Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf140Q5VVS0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf140Q5VVS0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms