Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LGSNQ5TDP6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms