Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms