Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITRM1Q5JRX3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms