Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LACTB2Q53H82 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms