Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms