Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MICAQ29983 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms