Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC18A3Q16572 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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