Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms