Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCOA1Q15788 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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NCOA1Q15788 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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NCOA1Q15788 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCOA1Q15788 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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