Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALX1Q15699 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALX1Q15699 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms