Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SHBQ15464 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SHBQ15464 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SHBQ15464 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SHBQ15464 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms