Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMD6Q15008 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms