Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCAPHQ15003 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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