Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NFIXQ14938 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFIXQ14938 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms