Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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