Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSPNQ14714 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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