Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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CKAP5Q14008 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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CKAP5Q14008 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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CKAP5Q14008 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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