Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms