Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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DNASE1L3Q13609 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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DNASE1L3Q13609 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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DNASE1L3Q13609 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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DNASE1L3Q13609 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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