Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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ITGB3BPQ13352 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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ITGB3BPQ13352 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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ITGB3BPQ13352 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ITGB3BPQ13352 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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ITGB3BPQ13352 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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ITGB3BPQ13352 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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ITGB3BPQ13352 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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ITGB3BPQ13352 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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ITGB3BPQ13352 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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