Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTPRSQ13332 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRSQ13332 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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