Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NME3Q13232 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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