Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3BQ13214 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms