Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPA4Q13156 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RPA4Q13156 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RPA4Q13156 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RPA4Q13156 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPA4Q13156 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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