Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GPS1Q13098 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GPS1Q13098 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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