Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM32Q13049 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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