Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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FOXC1Q12948 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXC1Q12948 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXC1Q12948 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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