Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FOXF1Q12946 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FOXF1Q12946 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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FOXF1Q12946 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXF1Q12946 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXF1Q12946 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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