Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNH2Q12809 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNH2Q12809 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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