Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBRQ0VD83 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms