Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms