Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms