Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EGR3Q06889 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms