Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RUNX1T1Q06455 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms